Merkator é sobre a ascensão de Hamburgo após a Guerra dos Trinta Anos.

Você visita cidades para coletar bens ou cumprir ordens. Os produtos recolhidos são adicionados às cidades quando um jogador visita uma cidade vizinha. Cumprir uma ordem faz com que você ganhe uma outra ordem melhor e mais complexa. Esta nova ordem é feita para que você possa cumprir novamente, embora o número de ordens que você pode ter é limitado. Cada ordem vale um certo número de pontos no final do jogo. Além disso, você pode trocar esses pontos por cartas especiais que fornecem bens adicionais em determinadas cidades ou mais pontos de vitória, se você cumprir certas condições, no final do jogo.

Dependendo da cidade que você deseja entrar, você recebe um recurso chamado de "tempo" ou você deve gastá-lo. Pagando uma taxa de tempo você tem permissão para acompanhar um outro jogador em sua viagem a uma cidade para cumprir suas ordens nesta cidade (mas não de recolher bens). O jogo termina quando um jogador recebe a ordem de maior valor, cumprindo a ordem de um nível abaixo.